解決方案

以客戶為中心,提供定制化或一站式的全棧解決方案,賦能千行百業

寶德高性能計算之生命科學解決方案
項目背景

多場景應用多需求:生物信息學(序列搜尋比對分析)--需要較大的內存容量和內存帶寬, 需要直連架構CPU;分子動力學--對網絡需求比較大,節點間需要使用低延時,高帶寬的Infiniband高速網;分子對接(藥物設計)--計算量非常大,消耗計算機時很多;測序儀離線處理--內存、存儲容量需求大,作業運行需要與作業調度系統結合;電子顯微鏡圖象處理--軟件內存需求和IO需求較大,計算時間長,系統穩定性、可靠性要求高;質譜儀原始資料處理--系統計算量大,計算時間長,系統穩定性,可靠性要求高。

方案介紹

基于寶德PowerScale 8000高性能計算集群是一個有機的、高性能、高可靠性的集群系統。系統的硬件都選用經過嚴格測試的主流產品,保證系統的可靠性;互聯系統各組件的網絡都是專用的高效網,通過集群核心的管理系統使得整個系統協調一致的運行,如單獨的一臺高性能計算機一樣為用戶提供統一的服務。PowerScale 8000向用戶提供一個單一計算機的界面。前置計算機負責與用戶交互,并在接受用戶提交的計算任務后通過調度器程序將任務分配給各個計算節點執行;運行結束后通過前置計算機將結果返回給用戶。程序運行過程中的進程間通信通過專用網絡進行。

方案解析

PowerScale 8000系統共配置10 個雙路八核刀片服務器。刀片式集群系統在計算密度、功耗散熱、運營成本、維護成本、可靠性等方面,都明顯優于其它系統,且為系統的擴容升級提供了良好的基礎。計算系統的選擇實現了多樣化,分別配置了最通用的雙路八核的刀片節點,這樣的配置可以更好滿足不同應用的需求。配置高性能的光纖 SAN 存儲系統,配置 20TB 磁盤陣列存儲,配置并行文件系統,實現了多分區的統一管理和多通道的并發讀寫。管理網絡采用千兆網絡,計算網絡采用Infiniband高速網絡互連;主要產品都采用了冗余設計(電源、風扇等),存儲系統采用雙鏈路冗余設計,系統的可靠性有較高保證;對于與測序儀鏈接的服務器和存儲設備,配置了雙機熱備,保證了系統的可靠性。寶德公司將為用戶提供完善的服務,包括安裝調試、系統優化、用戶培訓等,這些都不單獨收費,用戶不必考慮這些方面的費用。

方案優勢
  • 系統

    系統協調高效

  • 高性價比

    高性價比且方便后期擴容升級

  • 高可靠性

    高可靠性和完善的服務